Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms