Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms