Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms