Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms