Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms