Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms