Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms