Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL8BQ17RB0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL8BQ17RB0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL8BQ17RB0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL8BQ17RB0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL8BQ17RB0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL8BQ17RB0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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