Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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