Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms