Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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