Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms