Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB39AQ14964 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms