Protein–RNA interactions for Protein: Q14790

CASP8, Caspase-8, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8Q14790 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms