Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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