Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TUBA3CQ13748 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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