Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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