Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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