Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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