Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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