Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CHAF1BQ13112 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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