Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFT88Q13099 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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