Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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