Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms