Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms