Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms