Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN1Q05586 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms