Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms