Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms