Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms