Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms