Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2FP61218 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2FP61218 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2FP61218 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2FP61218 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2FP61218 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms