Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms