Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms