Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms