Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms