Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF9P41273 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms