Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms