Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms