Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms