Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CPS1P31327 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPS1P31327 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPS1P31327 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPS1P31327 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms