Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CD34P28906 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
CD34P28906 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CD34P28906 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CD34P28906 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms