Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PLNP26678 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PLNP26678 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms