Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms