Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF30P17039 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF30P17039 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms