Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP2A2P16615 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2A2P16615 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms