Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPGDP15428 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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