Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms