Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD63P08962 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD63P08962 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD63P08962 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD63P08962 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD63P08962 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms