Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA5P08648 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA5P08648 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA5P08648 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA5P08648 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms